Музыкальные темы для аниме «Наруто» были созданы композитором Тосио Масудой. Первый диск под названием «Naruto Original Soundtrack» был выпущен 3 апреля 2003 года и содержал 27 треков из первого сезона аниме. Второй, «Naruto Original Soundtrack II», вышел 18 марта 2004 года и состоял из 19 композиций. Третий, «Naruto Original Soundtrack III», включающий в себя 23 трека, был выпущен 27 апреля 2005 года.

Два диска, содержащие все начальные и завершающие темы из аниме, вышли 17 ноября 2004 года и 2 августа 2006 под названиями Naruto: Best Hit Collection и Naruto: Best Hit Collection II соответственно. Одна из закрывающих тем, композиция «Wind» исполнителя Акэбоси, в 2002 году заняла 10-е место в двадцатке лучших аниме-песен по версии журнала «Animage», а год спустя начальная тема «Kanashimi wo Yasashisa ni» оказалась в этом списке на 11-м месте. Из всех композиций сериала были отобраны восемь и выпущены как «Naruto in Rock -The Very Best Hit Collection Instrumental Version-» 19 декабря 2007 года. Также свой саундтрек-альбом вышел и к каждому из трех полнометражных фильмов. Кроме того, были записаны различные аудио-постановки.